Biyoteknoloji ve yapay zeka girişimi Beşik protein tasarımına yönelik üretken yaklaşımı, büyük müşteriler kazanması ve 24 milyon dolarlık yeni yatırımıyla başarıya ulaşıyor.
Şirket, bir yıldan biraz daha uzun bir süre önce, tam da büyük dilli modeller hakkındaki heyecanın gerçekten kızıştığı sırada gizlilikten çıktı. Biyoteknoloji alanındaki birçok yapay zeka şirketi, moleküler yapıyı doğal olarak anlamak için modeller eğitiyor; Cradle’ın görüşü, vücudumuzdaki proteinleri oluşturan uzun amino asit dizilerinin “uzaylı bir programlama diline benzediği” yönündeydi.
Bir kişinin bu dili öğrenmesi mümkün olmayabilir, ancak bir yapay zeka modeli öğrenebilir ve bunun yerine kişi bununla çalışabilir. Hala “bunu yapan bir protein yapın” diyemeseler de, 100 ilginç proteinden hangisinin oda sıcaklığında veya asidik bir ortamda hayatta kalma olasılığının daha yüksek olduğunu sorabilirler.
Yaklaşım Johnson & Johnson ve Novozymes gibi büyük ilaç geliştirme şirketlerinin dikkatini çekmiş gibi görünüyor. Sıfırdan faydalı ve işlevsel bir protein yaratmak, genellikle yıllar süren ve yüzlerce hatta binlerce ıslak laboratuvar deneyi gerektiren oldukça karmaşık bir süreçtir.
Cradle, teknolojisinin bu süreyi kısaltabileceğini ve gerekli deney sayısını önemli ölçüde azaltabileceğini söylüyor. Geliştirme süresinin yarıya indirildiği yönündeki iddiaları tam olarak kanıtlayamasa da, şirket içi geliştirmeden açıklayıcı bir örnek sağladı.
Yazılımlarını, bir RNA üretim enzimi olan T7 RNA polimerazın yüksek sıcaklıklara daha dayanıklı alternatif versiyonlarını üretmek için kullandılar. Normalde bir ekibin, kasıtlı olarak değiştirilmiş moleküllerin yüzde 5’inden azının istenen görünüme sahip olmasını bekleyebileceğini, ancak Cradle tarafından üretilen varyantların yüzde 70’inin artan stabilite gösterdiğini söylediler. Bu, bu tür dört veya beş deneysel çalışmanın tek seferde yürütülmesine eşdeğerdir.
Cradle, T7’ye ek olarak dahili olarak “toprağı arındırmak için kullanılabilecek bir dehalojenaz, kültürlü et ürünlerinde yaygın olarak kullanılan hücre bölünmesi yoluyla büyümeyi destekleyen bir büyüme faktörü, metabolik yolları düzenleyen ve aynı zamanda bazı hastalıkların anlaşılmasına yardımcı olan bir transaminaz üzerinde de çalışıyor. Cradle CEO’su ve kurucu ortağı Stef van Grieken, TechCrunch’a gönderdiği bir e-postada şunları söyledi: “Antikor tedavi edici bir ilaç olarak. “Modellerimizi mevcut araçları kullanarak şirket içi bir protein mühendisiyle karşılaştırdık ve Üretken AI tabanlı tasarımlarda önemli bir gelişme gördük.”
(Merak ediyorsanız bunlar 🙂
Resim Kredisi: Beşik
Bu kadar büyük iyileştirmeler mümkündür ve küçük, hatta küçücük iyileştirmeler bu süreçlere milyonlar yatıran şirketler tarafından memnuniyetle karşılanacaktır. Ancak elbette ilaç geliştirme sürecinde olası aday moleküllerin üretilmesinden daha fazlası var.
Van Grieken, “Platformumuzun Ar-Ge aşamasını hızlandırma ve ortaklarımızın biyo bazlı ürünleri pazara daha hızlı ve daha uygun maliyetle sunmalarına yardımcı olma potansiyelini zaten gösterebildik” dedi. “Aslında biz ve birkaç ortağımız platformumuzda birkaç deney turu tamamladığımızdan, modellerin farklı protein türleri ve görevlerde çok iyi genelleştirildiğini görüyoruz ki bu inanılmaz derecede heyecan verici.”
Teknoloji hiçbir şekilde ilaç geliştirmeyle sınırlı değil ve gıda ve endüstriyel uygulamalarda da kullanılabilir. Bu türdeki diğer araçlarda olduğu gibi, müşterilerin ilgisini çeken noktalardan biri de Cradle’ın çalışması için bir makine öğrenimi mühendisine ihtiyaç duymaması ve doğrudan bilim adamlarının ve laboratuvarların eline bırakılabilmesidir.
Van Grieken’e AB merkezli bir biyoteknoloji şirketi kurma konusundaki düşüncelerini sordum; ekipteki pek çok kişi daha önce Silikon Vadisi’ndeki büyük teknoloji firmalarında çalışmıştı.
“AB’de inşaat yapmanın artıları ve eksileri olduğunu gördük. Avrupa’da bir derin teknoloji girişimi için fon toplamak, Cradle gibi şirketlerle ilgilenen çok daha fazla sayıda modern “teknoloji-biyo” yatırımcısının bulunduğu ABD’ye kıyasla Avrupa’da daha karmaşıktır. Ayrıca Körfez Bölgesi’nde benzer düşüncelere sahip kuruculardan oluşan çok daha büyük bir topluluk var” dedi.
Van Grieken şöyle devam etti: “Ancak yetenek açısından bakıldığında Avrupa’nın yeterince takdir edilmediğini düşünüyorum.” “Örneğin Zürih’te tüm büyük teknoloji şirketlerinin (Apple, Google, Facebook) binlerce mühendisle temsil edildiği görülüyor. Bilgisayar bilimi ve moleküler biyoloji alanında dünyadaki en iyi üniversitelerden bazıları olan ETH ve EPFL’den gelen muhteşem bir yetenek havuzunuz var. Ve yetenek rekabeti Körfez Bölgesi’ndekinden kesinlikle daha az yoğun. Son olarak dünyanın en büyük ilaç ve biyoteknoloji şirketlerinin çoğu Avrupa’da bulunuyor, dolayısıyla müşterilerimize yakınız. Kesinlikle Avrupa ekosisteminin hızla geliştiğini düşünüyorum.”
Cradle’ın 24 milyon dolarlık A turu, geçen yılki 5,5 milyon dolarlık tohumu takip ediyor. Önceki yatırımcı Index Ventures, Kindred Capital’in (aynı zamanda bir tohum yatırımcısı) yanı sıra bireysel yatırımcılar Chris Gibson, Tom Glocer ve diğerlerinin de katılımıyla tura liderlik etti. Şirket, sermayeyi sizin gibi ekibini ve satışlarını büyütmek için kullanacağını söylüyor.
