Pseudomonas aeruginosa – un type courant de bactérie dans l’environnement et dans le corps humain – s’est développé génétiquement rapidement au cours des 200 dernières années et s’est adapté à notre environnement humain. De plus, il a développé relativement récemment de nouvelles propriétés qui le rendent désormais si dangereux en milieu hospitalier. Ceci a été rédigé par une équipe internationale de microbiologistes dans Science.
P. aeruginosa On les trouve presque partout sur terre : dans le sol et l’eau, dans la nature et les villes, dans les plantes, les animaux et les hommes – mais aussi de plus en plus souvent dans les hôpitaux. Il s’agit d’une bactérie hospitalière notoire qui s’installe de manière persistante sur et dans les équipements et qui résiste à de nombreux antibiotiques. Selon l’Organisation Mondiale de la Santé P. aeruginosaavec environ 500 000 décès par an, en plus du SARM une des bactéries hospitalières les plus préoccupantes. La bactérie tue principalement les patients atteints de maladies pulmonaires chroniques et dont le système immunitaire est vulnérable. Mais cela peut aussi rendre très malades les personnes sans pathologie sous-jacente.
Couches collantes
La bactérie doit sa persistance à un certain nombre de propriétés. Par exemple, il sollicite peu son environnement et les bactéries forment ensemble des couches collantes, ou biofilms. Cela signifie qu’ils adhèrent aux surfaces et sont protégés contre les influences extérieures, telles que les désinfectants et les antibiotiques. De plus, ils possèdent des gènes qui les rendent résistants aux antibiotiques et leur permettent d’échapper au système immunitaire de leur hôte.
On ne savait pas encore comment cette bactérie, initialement présente principalement dans la nature, s’était spécialisée si efficacement en bactérie hospitalière. Les chercheurs de Grande-Bretagne, d’Irlande, de France, d’Italie et du Canada ont donc examiné dix mille P. aeruginosa-des échantillons provenant de toutes sortes d’environnements partout dans le monde, de différents groupes de patients et de personnes en bonne santé. Certains échantillons avaient plus de 200 ans. Les microbiologistes ont cartographié génétiquement tous ces échantillons et recherché les différences, les similitudes et les évolutions au fil du temps.
Sur la base des données génétiques, ils ont ensuite compilé un arbre généalogique montrant les relations mutuelles. Cela a montré que différents groupes au sein de l’espèce P. aeruginosa Au cours des 200 dernières années, elles ont repris toutes sortes de gènes provenant d’autres espèces bactériennes de l’environnement, après quoi elles se sont mieux adaptées à l’environnement humain. Par la suite, les processus de sélection naturelle les ont rendues encore plus efficaces en tant que bactéries hospitalières.
Remarquablement, sept patients sur dix étaient porteurs de bactéries appartenant à des « branches » de l’arbre généalogique qui ne se sont séparées du reste qu’au cours des 200 dernières années – donc très récemment, en termes d’évolution. Depuis, les souches virulentes se sont propagées à travers le monde, grâce à des villes et des hôpitaux de plus en plus densément peuplés.
Fibrose kystique
Certaines variantes semblent infecter principalement les patients atteints de mucoviscidose (FK ou mucoviscidose), tandis que d’autres infectent en réalité des patients atteints d’autres pathologies. Utilisé chez les patients atteints de mucoviscidose P. aeruginosa un défaut immunitaire génétique qui n’avait pas été découvert auparavant, écrivent les chercheurs. Chez tout le monde, le système immunitaire utilise des macrophages : des globules blancs qui « mangent » les agents pathogènes, pour ainsi dire, puis les décomposent. Mais chez les patients atteints de mucoviscidose, cela reste P. aeruginosa sont simplement actifs dans ces macrophages, permettant à la bactérie de se propager et de s’adapter davantage.
D’autres variantes de la FK prospèrent chez les patients non FK P. aeruginosa. Ceux-ci ont leurs propres adaptations spécifiques, ce qui les rend soit échappant au système immunitaire, soit résistants aux antibiotiques, ou les deux. Jusqu’à présent, on ne savait pas que d’autres groupes de patients étaient également vulnérables à cela, selon l’étude. Science. Cela signifie que les hôpitaux doivent être plus vigilants face à la propagation de cette bactérie, par exemple dans les services hospitaliers.
Les nouvelles données génétiques constituent avant tout un point de départ pour des recherches plus approfondies, affirment les chercheurs. Maintenant que l’on en sait beaucoup plus sur les gènes responsables, par exemple, de la formation de biofilms, de la production d’adhésifs protecteurs, de l’évasion immunitaire et de la résistance aux antibiotiques, ils peuvent commencer à rechercher des moyens de prévention et de traitement plus ciblés.