Shipman fue declarado culpable en enero de 2000 y condenado a cadena perpetua; sin embargo, nunca se determinó ninguna motivación.
Shipman luego murió por suicidio, en prisión, el 13 de enero de 2004. Según el Independiente, «El asesino en serie Harold Shipman programó su suicidio para que su esposa pudiera cobrar una pensión de £ 100,000, según los registros secretos de la prisión». El artículo continuaba: «Planeó acabar con su vida antes de cumplir 60 años para poder garantizarle a la señora Shipman un pago global de 100.000 libras esterlinas y 10.000 libras esterlinas un año después de la pensión de su médico de cabecera. Si él muriera después de ese momento, ella solo habría tenía derecho a 5.000 libras esterlinas al año».