Shameik Moore tarafından seslendirilen Miles Morales, Brooklyn Visions Academy adlı daha prestijli bir okul için normal okulunu bırakan Brooklyn, New York’tan bir gençtir. Babası Jefferson bir polis memuru; annesi Rio bir hemşiredir; ve sanat ve müzik konusunda tutkulu.
Bir gün amcası Aaron ile metroda grafiti sanatı yapan Miles, kendisine süper güçler veren bir örümcek tarafından ısırılır. Örümceğin nereden geldiği hakkında daha fazla bilgi edinmeye çalıştığında, Örümcek Adam ile Kingpin arasındaki bir kavgaya tanık olur. Örümcek Adam, Kingpin’in uzayı ve zamanı yok edebilecek devasa bir makine kullanmasını engellemeye çalışıyor ve bu sırada Örümcek Adam, Kingpin tarafından öldürülüyor. Yine de ölmeden önce Örümcek Adam, Miles’ın kendisi gibi olduğunu hisseder ve Miles’a Kingpin’i durduracağına ve çarpıştırıcı dedikleri makineyi yok edeceğine söz verir.
Başlangıçta, Miles güçlerini yeni yeni öğrenmeye başlıyor; yol boyunca, Kingpin’in çarpıştırıcısı aracılığıyla Peter’ın dünyasına getirilen birkaç Örümcek insanla tanışır. Filmin sonunda, tam iki gündür kendi evreninin resmi Örümcek Adamı olmuştur.