E.coli, önemli bir sağlık sorunu olan ve sayısız ölüme yol açan bir bakteri türüdür. Bakteri sağlıklı insan ve hayvanların bağırsaklarında bulunurken, evriminin tarihi bilinmiyor. Şimdi, McMaster Üniversitesi’ndeki araştırmacılar, 16. yüzyıldan kalma bir İtalyan mumyasının safra taşını kullanarak E.coli’nin ilk antik genomunu başarıyla yeniden yapılandırdılar. E.coli pandemilere yol açmaz ve daha çok kommensal olarak adlandırılır. Bu tür bakteriler vücudumuzun içine girer ve konakçı savunmasız hale geldiğinde saldırmak için bekler. Genellikle stres, bağışıklık yetmezliği veya hastalık gibi durumlarda saldırırlar.
Dünya genelinde yaklaşık 200 milyon ölüme neden olan Kara Ölüm gibi pandemiler iyi belgelenmiştir. Ancak, bakteri insan sağlığını da önemli ölçüde etkilemiş olsa bile, E.coli’nin kaybettiği hayatlar hakkında mevcut hiçbir tarihsel veri yoktur.
“Geçmişimizde toplu ölümlerin tek anlatısı olarak pandemiye neden olan patojenlere sıkı bir odaklanma, yaşanan yaşamların stresinden kaynaklanan fırsatçı müştereklerden kaynaklanan büyük yükü gözden kaçırıyor.” söz konusu evrimsel genetikçi Hendrik Poinar, McMaster’ın Antik DNA Merkezi’nin direktörü ve üniversitenin Michael G. DeGroote Enfeksiyon Hastalıkları Araştırma Enstitüsü’nün baş araştırmacısı.
Dergide yayınlanan çalışmada iletişim Biyolojisi, Araştırmacılar, E.coli’nin şimdiye kadarki evrimi hakkında bir fikir verecek 400 yıllık atasını yaratmayı amaçladılar. 1983 yılında Napoli’deki Saint Domenico Maggiore Manastırı’ndan ortaya çıkarılan bir grup İtalyan soylusunun mumyalanmış bedenlerinden parçalar kullandılar.
Ekip, 1586’da 48 yaşında öldüğüne inanılan soylulardan birinin mumyasını inceledi. Araştırmacılar ayrıca bireyin safra kesesi taşlarına sahip olduğunu ve bu nedenle safra kesesinde kronik iltihaplanma olduğunu kaydetti.
“Bu kalıntıları incelerken bu adamda E. coli olduğuna dair hiçbir kanıt yoktu. Çiçek hastalığı gibi bir enfeksiyonun aksine, fizyolojik göstergeler yoktur. McMaster’da biyoinformatik lisansüstü öğrencisi olan George Long, “Kimse bunun ne olduğunu bilmiyordu” dedi. Long aynı zamanda çalışmanın baş yazarıdır ve mumyanın analizini yürütmüştür.
Araştırmacılar, bakterinin parçalarını vücuttan izole ettiler ve materyali genomu geliştirmek için kullandılar. Bununla, genomun işlevlerini anlayabildiler ve şimdi bu tür gizli patojenleri arayan diğer araştırmacılara yardım etmeyi umuyorlar.
E.coli’nin çoğu formu, bağırsaklarında yaşarken konakçıları için tehlike oluşturmaz. Ancak bazı suşların ölümcül gıda zehirlenmesi salgınlarına ve kan dolaşımı enfeksiyonlarına bile neden olduğu bulunmuştur. Ek olarak, E.coli uyarlanabilir, bu da onu tedavilere karşı dirençli kılar.
